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Enregistrement W2036071277 · doi:10.1139/w03-040

Bacterial extracellular protease activities in field soils under different fertilizer managements

2003· article· en· W2036071277 sur OpenAlexvenueno aff
K. Watanabe, Jyunich Sakai, Koichi Hayano

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan International Research Center for Agricultural Sciences
Mots-clésSubtilisinEndopeptidaseBacillus subtilisProteaseSerine proteaseBiochemistryProteasesBiologyAmino acidSerineMicrobiologyEnzymeChemistryBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The major extracellular endopeptidase from Bacillus subtilis PF212 (isolated from paddy field soil) and B. subtilis CF80 (isolated from upland field soil) belongs to the group of serine proteases produced by Bacillus spp. known as subtilisins (optimum pH 7.0, optimum temperature 60 degrees C, and molecular mass 28 kDa). The NH2-terminal amino acid sequence (20 amino acids) of the endopeptidase from (i) strain CF80 was identical with that of subtilisin BPN' and (ii) strain PF212 was identical with that of subtilisin Amylosacchariticus. The properties (i.e., effect of inhibitors) of these endopeptidases were similar to those of the overall soil endopeptidase and soil endopeptidases extracted from paddy field soil. From the numbers of B. subtilis we isolated from paddy fields and found to produce a subtilisin-like serine protease, it seemed possible to consider that subtilisin was one of the soil endopeptidases in paddy field soils. The major extracellular endopeptidase from Serratia marcescens (strains 4-12-132, 4-12-131, and 4-60-110) isolated from upland field soils applied with animal slurry is a serratial metalloprotease (optimum pH 9.5, optimum temperature 40 degrees C, and molecular mass 50 kDa). The NH2-terminal amino acid sequence (20 amino acids) of the endopeptidase from strain 4-12-132 was identical with that of serratial metalloprotease, and partial DNA sequence of the endopeptidase gene of S. marcescens 4-12-132 had high homology with that of the serratial metalloprotease gene. The properties (i.e., effect of inhibitors) of this endopeptidase were similar to those of the overall soil endopeptidase in upland fields applied with animal slurry. Thus, it was possible to consider that serratial metalloprotease was one of the soil endopeptidases in upland fields applied with animal slurry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,205
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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