The 30th anniversary of Campylobacter, Helicobacter, and Related Organisms workshops—what have we learned in three decades?
Notice bibliographique
Résumé
As we commemorate the 30th anniversary of the Campylobacter, Helicobacter and Related Organisms (CHRO) workshops with this special Frontiers edition, we look back upon three decades of research and provide some highlights from the 16th International CHRO meeting. As Martin Skirrow noted, Elizabeth King was the first to isolate campylobacters in the 1950’s, although Escherich himself provided drawings of these fecal organisms back in the 1880’s. Helicobacter is a more recent organism, first described to be the causative agent of stomach ulcers at a CHRO meeting by Barry Marshall and Robin Warren – who then later received the Nobel Prize for their findings that bacteria could cause diseases previously believed to be caused by human factors. Studies of the intersection of host microbial ecology and pathogen infection have been pioneered by scientists such as Brett Finlay, who described his current work on this topic. And as general antibiotics are routinely administered, we see a rise in bacterial antibiotic resistance. Julian Davies emphasized that there is a growing need for the development of new bioactive compounds on the horizon as we advance our knowledge on these pathogens. The first genome of C. jejuni was published in 2000; now one decade later we have 30 Campyobacter taxa sequenced, and this number continues to rise quickly. However, we continue to obtain “unexpected results” as a pioneer in CHRO research, Martin Blaser explained – i.e., although H. pylori is now classified as a level I carcinogen, there may be benefits to carrying this organism as part of your normal flora. Other findings indicate that Campylobacters and Helicobacters do not follow classic paradigms of other well-characterized gastrointestinal pathogens. And we are learning that there is a whole world of interesting related organisms beyond C. jejuni and H. pylori. This review summarizes some of the history of CHRO research and the exciting directions ahead.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,003 |
| Communication savante | 0,009 | 0,009 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,008 |
| Intégrité de la recherche | 0,006 | 0,011 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,072 | 0,037 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».