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Enregistrement W2036116522 · doi:10.1139/g03-015

Mapping quantitative trait loci for a common bean (<i>Phaseolus vulgaris</i>L.) ideotype

2003· article· en· W2036116522 sur OpenAlexafffundvenue
Aaron D. Beattie, Jamie Larsen, K. Peter Pauls

Notice bibliographique

RevueGenome · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistry of Rural Affairs
Mots-clésBiologyIdeotypePhaseolusQuantitative trait locusPopulationGeneticsGenetic linkageTraitMolecular markerSelection (genetic algorithm)BotanyCultivarGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Breeding a model plant that encompasses individual traits thought to enhance yield potential, known as ideotype breeding, has traditionally focused on phenotypic selection of plants with desirable morphological traits. Broadening this breeding method to the molecular level through the use of molecular markers would avoid the environmental interactions associated with phenotypic selection. A population of 110 F5 recombinant inbred lines (RILs), derived from the cross between WO3391 and 'OAC Speedvale', was used to develop a genetic linkage map consisting of 105 random amplified polymorphic DNA (RAPD), simple sequence repeat (SSR), and sequence-tagged site (STS) markers. The map has a total length of 641 cM distributed across 8 linkage groups (LGs). Five of them were aligned on the core linkage map of bean. Twenty-one quantitative trait loci (QTLs) were identified over three environments for eight agronomic and architectural traits previously defined for a bean (Phaseolus vulgaris L.) ideotype. The QTLs were mapped to seven LGs with several regions containing QTLs for multiple traits. At least one QTL was located for each trait and a maximum of four were associated with lodging. Total explained phenotypic variance ranged from 10.6% for hypocotyl diameter to 45.4% for maturity. Some of the QTLs identified will be useful for early generation selection of tall, upright, high-yielding lines in a breeding program.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,966
Score d'incertitude au seuil0,217

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2003
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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