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Enregistrement W2036162594 · doi:10.1016/s0736-0266(01)00110-3

The characterization of versican and its message in human articular cartilage and intervertebral disc

2002· article· en· W2036162594 sur OpenAlexafffund
Robert SZTROLOVICS, Judy Grover, Gabriella Cs‐Szabó, Shui‐Liang Shi, Yiping Zhang, John S. Mort, Peter J. Roughley

Notice bibliographique

RevueJournal of Orthopaedic Research® · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensMcGill UniversityShriners Hospitals for Children - Canada
Organismes subventionnairesArthritis Society
Mots-clésVersicanCartilageExonIntervertebral discGene isoformKeratan sulfateAlternative splicingProteoglycanAggrecanAnatomyRNA splicingChemistryBiologyCell biologyPathologyOsteoarthritisArticular cartilageGeneticsMedicineGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Splicing variation of the versican message and size heterogeneity of the versican core protein were analyzed in human articular cartilage and intervertebral disc. Splicing variation of the message was studied by PCR analysis to detect the presence or absence of exons 7 and 8, which encode large chondroitin sulfate attachment regions. At all ages in normal cartilage from the third trimester fetus to the mature adult, the presence of the versican isoform possessing exon 8 but not exon 7 (V1) could be readily detected. The message isoforms possessing neither exon 7 nor 8 (V3) or both exons 7 and 8 (V0) were only detectable in the fetus, and the isoform possessing only exon 7 (V2) was never detected. In osteoarthritic cartilage and in adult intervertebral disc the versican message pattern was the same as that observed in the normal adult with only the isoform possessing exon 8 being detected. Core protein heterogeneity was studied by immunoblotting following enzymic removal of the glycosaminoglycan chains from the proteoglycan, using an antibody recognizing the globular G1 region of versican. All articular cartilage extracts from the fetus to the mature adult contained multiple core protein sizes of greater than 200 kDa. The adult cartilage extracts tended to have an increased proportion of the smaller sized core proteins and osteoarthritic cartilage possessed similar core protein sizes to the normal adult. In contrast, intervertebral disc at all post-natal ages showed a greater range of size heterogeneity with a prominent component of about 50 kDa. The abundance of this component increased if the samples were treated with keratanase prior to analysis, suggesting that the G1 region of versican in disc can be substituted with keratan sulfate. The increased presence of versican in the disc relative to articular cartilage may suggest a more pronounced functional role for this proteoglycan, particularly in the nucleus pulposus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,144
Score d'incertitude au seuil0,204

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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