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Enregistrement W2036192956 · doi:10.3389/fpls.2014.00046

Role of callose synthases in transfer cell wall development in tocopherol deficient Arabidopsis mutants

2014· article· en· W2036192956 sur OpenAlexafffund
Hiroshi Maéda, Wan Song, Tammy L. Sage, Dean DellaPenna

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCollege of Engineering, Michigan State UniversityMichigan State UniversityNational Science Foundation
Mots-clésCalloseArabidopsisArabidopsis thalianaBiologyMutantWild typeCell biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tocopherols (vitamin E) are lipid-soluble antioxidants produced by all plants and algae, and many cyanobacteria, yet their functions in these photosynthetic organisms are still not fully understood. We have previously reported that the vitamin E deficient 2 (vte2) mutant of Arabidopsis thaliana is sensitive to low temperature (LT) due to impaired transfer cell wall (TCW) development and photoassimilate export associated with massive callose deposition in transfer cells of the phloem. To further understand the roles of tocopherols in LT induced TCW development we compared the global transcript profiles of vte2 and wild-type leaves during LT treatment. Tocopherol deficiency had no significant impact on global gene expression in permissive conditions, but significantly affected expression of 77 genes after 48 h of LT treatment. In vte2 relative to wild type, genes associated with solute transport were repressed, while those involved in various pathogen responses and cell wall modifications, including two members of callose synthase gene family, GLUCAN SYNTHASE LIKE 4 (GSL4) and GSL11, were induced. However, introduction of gsl4 or gsl11 mutations individually into the vte2 background did not suppress callose deposition or the overall LT-induced phenotypes of vte2. Intriguingly, introduction of a mutation disrupting GSL5, the major GSL responsible for pathogen-induced callose deposition, into vte2 substantially reduced vascular callose deposition at LT, but again had no effect on the photoassimilate export phenotype of LT-treated vte2. These results suggest that GSL5 plays a major role in TCW callose deposition in LT-treated vte2 but that this GSL5-dependent callose deposition is not the primary cause of the impaired photoassimilate export phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,442

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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