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Enregistrement W2036298771 · doi:10.1186/1471-2105-12-s5-s8

Promoting ranking diversity for genomics search with relevance-novelty combined model

2011· article· en· W2036298771 sur OpenAlex
Xiaoshi Yin, Zhoujun Li, Jimmy Xiangji Huang, Xiaohua Hu

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBMC Bioinformatics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueInformation Retrieval and Search Behavior
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesBeihang UniversityNational Natural Science Foundation of ChinaState Key Laboratory of Software Development EnvironmentNational Science Foundation
Mots-clésRelevance (law)NoveltyComputer scienceInformation retrievalRanking (information retrieval)Term (time)Data science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In the biomedical domain, the desired information of a question (query) asked by biologists usually is a list of a certain type of entities covering different aspects that are related to the question, such as genes, proteins, diseases, mutations, etc. Hence it is important for a biomedical information retrieval system to be able to provide comprehensive and diverse answers to fulfill biologists' information needs. However, traditional retrieval models assume that the relevance of a document is independent of the relevance of other documents. This assumption may result in high redundancy and low diversity in the retrieval ranked lists. RESULTS: In this paper, we propose a relevance-novelty combined model, named RelNov model, based on the framework of an undirected graphical model. It consists of two component models, namely the aspect-term relevance model and the aspect-term novelty model. They model the relevance of a document and the novelty of a document respectively. We show that our approach can achieve 16.4% improvement over the highest aspect level MAP reported in the TREC 2007 Genomics track, and 9.8% improvement over the highest passage level MAP reported in the TREC 2007 Genomics track. CONCLUSIONS: The proposed combination model which models aspects, terms, topic relevance and document novelty as potential functions is demonstrated to be effective in promoting ranking diversity as well as in improving relevance of ranked lists for genomics search. We also show that the use of aspect plays an important role in the model. Moreover, the proposed model can integrate various different relevance and novelty measures easily.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,976
Score d'incertitude au seuil0,513

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,099
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,157 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle