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Enregistrement W2036360969 · doi:10.1242/dev.00542

Mutations in <i>Arabidopsis</i> condensin genes disrupt embryogenesis,meristem organization and segregation of homologous chromosomes during meiosis

2003· article· en· W2036360969 sur OpenAlexaff
Najeeb U. Siddiqui, Patricia Stronghill, Ronald E. Dengler, Clare A. Hasenkampf, C. Daniel Riggs

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneticsArabidopsisGeneCondensinMutantSuspensorHomologous chromosomeHomologous recombinationCell biologyMolecular biologyChromosome segregationChromosomeZygoteEmbryogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proper chromatin condensation and sister chromatid resolution are essential for the maintenance of chromosomal integrity during cell division, and is in part mediated by a conserved multisubunit apparatus termed the condensin complex. The core subunits of the complex are members of the SMC2 (Structural Maintenance of Chromosomes) and SMC4 gene families. We have cloned an Arabidopsis gene, AtCAP-E1, which is a functional ortholog of the yeast SMC2 gene. A second, highly homologous SMC2 gene, AtCAPE-2, was identified by the Arabidopsis genome project. SMC2 gene expression in Arabidopsis was correlated with the mitotic activity of tissues, with high level expression observed in meristematic cells. The two genes are differentially expressed with AtCAP-E1 accounting for more than 85% of the total SMC2 transcript pool. The titan3 mutant is the result of a T-DNA insertion into AtCAP-E1, but other than subtle endosperm defects, titan3 is viable and fecund. We identified a T-DNA insertion mutant of AtCAP-E2, which showed no obvious mutant phenotype, indicating that the two genes are functionally redundant. Genetic crosses were employed to examine the consequences of reduced SMC2 levels. Both male and female gametogenesis were compromised in double mutant spores. Embryo lethality was observed for both double homozygous and AtCAP-E1(-/-), AtCAP-E2(+/-) plants; arrest occurred at or before the globular stage and was associated with altered planes of cell division in both the suspensor and the embryo. Down regulation of both genes by antisense technology, as well as in AtCAP-E1(+/-), AtCAP-E2(-/-) plants results in meristem disorganization and fasciation. Our data are consistent with the interpretation that threshold levels of SMC2 proteins are required for normal development and that AtCAP-E2 may have a higher affinity for its target than AtCAP-E1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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