MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2036390414 · doi:10.1074/jbc.m209893200

COX16 Encodes a Novel Protein Required for the Assembly of Cytochrome Oxidase in Saccharomyces cerevisiae

2003· article· en· W2036390414 sur OpenAlexaff
Christopher G. Carlson, Antoni Barrientos, Alexander Tzagoloff, D. Moira Glerum

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésSaccharomyces cerevisiaeCytochrome c oxidaseChemistryBiochemistryCytochromeYeastEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have characterized Cox16p, a new cytochrome oxidase (COX) assembly factor. This protein is encoded by COX16, corresponding to the previously uncharacterized open reading frame YJL003w of the yeast genome. COX16 was identified in studies of COX-deficient mutants previously assigned to complementation group G22 of a collection of yeast pet mutants. To determine its location, Cox16p was tagged with a Myc epitope at the C terminus. The fusion protein, when expressed from a low-copy plasmid, complements the mutant and is detected solely in mitochondria. Cox16p-myc is an integral component of the mitochondrial inner membrane, with its C terminus exposed to the intermembrane space. Cox16 homologues are found in both the human and murine genomes, although human COX16 does not complement the yeast mutant. Cox16p does not appear to be involved in maturation of subunit 2, copper recruitment, or heme A biosynthesis. Cox16p is thus a new protein in the growing family of eukaryotic COX assembly factors for which there are as yet no specific functions known. Like other recently described nuclear gene products involved in expression of cytochrome oxidase, COX16 is a candidate for screening in inherited human COX deficiencies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetFungal and yeast genetics researchTravaux en français237 207