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Enregistrement W2036412247 · doi:10.1074/jbc.m309482200

Transcriptional Up-regulation of Endothelial Cell Matrix Metalloproteinase-2 in Response to Extracellular Cues Involves GATA-2

2003· article· en· W2036412247 sur OpenAlexaff
Xiaoyan Han, Pamela J. Boyd, Stephen Colgan, Joseph A. Madri, Tara L. Haas

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAngiogenesisMatrix metalloproteinaseMolecular biologyExtracellular matrixBiologyEndothelial stem cellCell biologyWestern blotPromoterCell cultureChemistryGene expressionGeneIn vitroGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Matrix metalloproteinase-2 (MMP-2) plays a critical role in endothelial cells during the processes of angiogenesis and vascular remodeling. Endothelial cell production of MMP-2 is greatly enhanced when cells are cultured within a three-dimensional type I collagen matrix coinciding with the increased invasive and migratory phenotype of the cells. To define the transcriptional regulation of MMP-2 in rat microvascular endothelial cells, we performed promoter-reporter assays with a series of promoter truncations. Activity of the full promoter was significantly greater in cells cultured within three-dimensional type I collagen compared with cells cultured as a monolayer (two-dimensional) on type I collagen. Truncation of the region encompassing base pairs -1562 to -1375 (relative to the start codon) of the MMP-2 promoter resulted in loss of this differential activity of the MMP-2 promoter. Analysis of this region indicated two putative GATA-2 binding domains between -1437 and -1387. Southwestern blot analysis and electrophoretic mobility shift assays confirmed the binding of GATA-2 to this region of the MMP-2 promoter. Overexpression of GATA-2 in COS-7 cells significantly increased the activity of the full-length MMP-2 promoter-luciferase construct. Endothelial cells expressed greater levels of GATA-2 protein in three-dimensional compared with two-dimensional cultures, and activity of the -1437/-1387 region of the MMP-2 promoter was significantly greater in three-dimensional cultured endothelial cells. Together, these results indicate GATA-2 regulation of the MMP-2 promoter in endothelial cells and that the GATA-2 binding domain is sufficient to drive increased activity of the MMP-2 promoter in response to an extracellular matrix stimulus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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