The exon junction complex: A splicing factor for long intron containing transcripts?
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Notice bibliographique
Résumé
Alternative splicing provides one of the major mechanisms by which eukaryotic genomes can increase the diversity of transcripts and protein products encoded by a limited amount of genes. The spliceosome is involved in recognizing and removing intronic sequences and it is guided in this activity by splicing regulatory factors that determine the particular splice sites that are to be recognized and used for intron removal. Thus, by modulating the spliceosome's activity, these factors can cause different mRNA transcripts to be generated from the same precursor mRNA. In a recent RNAi screen for factors modulating RAS/MAPK signaling, we identified the Drosophila exon junction complex (EJC) as one of the components regulating the splicing of mapk transcripts. We showed that removal of EJC components caused multiple consecutive mapk exons to be skipped. Moreover, we determined that other fly genes that, like mapk, had particularly large introns, were also sensitive to disruption of the EJC. The importance of intron length in determining sensitivity to EJC disruption suggests that the EJC is functioning in exon definition, a splicing mechanism that occurs for long introns in particular.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle