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Enregistrement W2036822760 · doi:10.1139/o08-147

A glycosylated antitumor ether lipid kills cells via paraptosis-like cell death

2009· article· en· W2036822760 sur OpenAlexaffvenue
Pranati Samadder, Robert Bittman, Hoe‐Sup Byun, Gilbert Arthur

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophagyATG5VacuoleProgrammed cell deathCell biologyApoptosisChinese hamster ovary cellChemistryBiologyCaspaseCaspase 3BiochemistryCytoplasm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycosylated antitumor ether lipids (GAELs) have superior anticancer properties relative to the alkyllysophospholipid class, but there have been no studies of the mechanisms of these compounds. The prototype GAEL, 1-O-hexadecyl-2-O-methyl-3-O-(2'-amino-2'-deoxy-beta-D-glucopyranosyl)-sn-glycerol (Gln), effectively killed mouse embryonic fibroblasts (MEFs) lacking key molecules involved in caspase-dependent apoptosis, and cell death was not prevented by caspase inhibitors. Gln did not cause a loss of mitochondrial membrane potential, even in rounded-up dying cells. Gln stimulated the appearance and accumulation of LC3-II, a protein marker for autophagy, in a variety of cells, including wild-type MEFs, but not in MEFs lacking ATG5, a key protein required for autophagy. Gln induced LC3 puncta formation in Chinese hamster ovary cells stably expressing a LC3-green fluorescent protein fusion protein. Thus, Gln appears to induce autophagy. Autophagy was mTOR-independent and was not inhibited by 3-methyladenine or wortmannin. Although Gln is toxic, cellular ability to undergo autophagy was not essential for its toxicity. Furthermore, the GAEL analog 2-deoxy-C-Glc induced LC3 puncta formation but did not kill the cells. Gln, but not 2-deoxy-C-Glc, caused the accumulation of cytoplasmic acidic vacuoles in the cells. Our data suggest that GAELs may activate autophagy; however, GAELs do not kill cells by apoptosis or autophagy but rather by a paraptosis-like cell death mechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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