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Enregistrement W2036909872 · doi:10.1139/g00-096

Development of microsatellite markers in potato and their use in phylogenetic and fingerprinting analyses

2001· article· en· W2036909872 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenome · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrosatelliteBiologyLocus (genetics)Phylogenetic treePrimer (cosmetics)CultivarDNA profilingGeneticsgenomic DNAAlleleBotanyGeneDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Three genomic libraries were constructed using a mixture of DNA from Solanum phureja Juz. & Buk., and S. chacoense Bitt. Two of the libraries were enriched for ATT and GT repeats (a 27-fold enrichment was achieved). In total, 3500 clones of the conventional library, 1,000 of the library enriched for ATT, and 12,000 of the one enriched for GT were screened with five different repeat motifs, and a total of 18 primer pairs was obtained. Another group of 12 primer pairs was obtained from the SSR-containing sequences in the public databases (18 SSR-containing sequences were utilized). From among 30 newly developed primer pairs, 12 previously published ones, and 12 pairs developed for tomato, 7 were used to identify 12 different potato cultivars and introductions, and 12 were used to study phylogenetic distance among seven wild and cultivated potato species. Two SSR markers were sufficient to discriminate the 12 cultivars. The mean number of alleles per polymorphic locus was 5 for the 12 cultivars and 4.5 for the seven species. The results obtained in this study confirm those achieved in similar studies in other plant species regarding the abundance and use of SSR markers in identifying species and cultivars.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,850
Score d'incertitude au seuil0,156

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle