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Enregistrement W2036915721 · doi:10.1016/j.gene.2014.12.016

Priming with a double-stranded DNA virus alters Brassica rapa seed architecture and facilitates a defense response

2014· article· en· W2036915721 sur OpenAlexafffund
Melanie Kalischuk, Dan Johnson, L. M. Kawchuk

Notice bibliographique

RevueGene · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversity of LethbridgeAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaAlberta Crop Industry Development Fund
Mots-clésBiologyBrassica rapaTranscriptomeBiotic stressBrassicaCanolaDNA virusGeneticsGeneAbiotic stressGenomeBotanyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Abiotic and biotic stresses alter genome stability and physiology of plants. Under some stressful situations, a state of stress tolerance can be passed on to the offspring rendering them more suitable to stressful events than their parents. In plants, the exploration of transgenerational response has remained exclusive to model species, such as Arabidopsis thaliana. Here, we expand transgenerational research to include Brassica rapa, a close relative to economically important plant canola (Brassica napus), as it is exposed to the biotic stress of a double-stranded DNA virus Cauliflower mosaic virus (CaMV). RESULTS: Parent plants exposed to a low dose of 50ng purified CaMV virions just prior to the bolting stage produced significantly larger seeds than mock inoculated and healthy treatments. The progeny from these large seeds displayed resistance to the pathogen stress applied in the parental generation. Differences in defense pathways involving fatty acids, and primary and secondary metabolites were detected by de novo transcriptome sequencing of CaMV challenged progeny exhibiting different levels of resistance. CONCLUSIONS: Our study highlights biological and cellular processes that may be linked to the growth and yield of economically important B. rapa, in a transgenerational manner. Although much remains unknown as to the mechanisms behind transgenerational inheritance, our work shows a disease resistance response that persists for several weeks and is associated with an increase in seed size. Evidence suggests that a number of changes involved in the persistent stress adaption are reflected in the transcriptome. The results from this study demonstrate that treating B. rapa with dsDNA virus within a critical time frame and with a specified amount of infectious pathogen produces economically important agricultural plants with superior coping strategies for growing in unfavorable conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,163
Score d'incertitude au seuil0,214

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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