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Enregistrement W2036924945 · doi:10.1002/dvdy.1174

Claudin‐6: A novel tight junction molecule is developmentally regulated in mouse embryonic epithelium

2001· article· en· W2036924945 sur OpenAlexaff
Kursad Turksen, Tammy‐Claire Troy

Notice bibliographique

RevueDevelopmental Dynamics · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBarrier Structure and Function Studies
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyEmbryoid bodyMolecular biologyCell biologycDNA libraryClaudinTight junctionComplementary DNAOpen reading frameEmbryonic stem cellTransmembrane proteinclone (Java method)KeratinTransfectionCell culturePeptide sequenceGeneGeneticsInduced pluripotent stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Embryonic stem (ES) cells differentiating into embryoid bodies (EBs) have been shown to mimic events of very early development and have become a convenient system in which to identify and study early epithelial specific genes. We describe here the primary structure of a mouse epithelial-specific tight junction gene and its expression patterns in differentiating ES cell-derived EBs in vitro. Sequencing of a clone identified by differential display of 4- vs. 6-day-old EB cells revealed it to overlap exactly with a larger cDNA clone (20M24) that had been isolated, but not characterised, in a screen of an ectodermal library. Complete sequencing and analysis of 20M24 revealed an open reading frame for a 219-amino acid protein with structural features of a transmembrane protein. In cell-free reticulocyte lysates, a 20M24 cDNA corresponding to the open reading frame (660 bp) directed the synthesis of a approximately 23-kDa protein that was localized to cell membranes at cell-cell junctions in transfected HEK-293 cells. Database searches indicated that the cDNA was identical to a recently identified member of the Claudin tight junction family, namely Claudin-6. ES cell cultures were used to further examine the expression pattern of Claudin-6 by whole mount in situ hybridisation during aggregation-induced commitment to epithelial differentiation in vitro. The results indicate that Claudin-6 is one of the earliest molecules to be expressed in ES cells committed to the epithelial fate, and the onset of its expression coincides with the expression of the early epithelial marker, keratin 8 (K8). The initiation of expression of Claudin-6 in vitro is dependent upon plating density as well as serum components. In addition, it was found that Claudin-6 expression is inhibited by Noggin, the Bone Morphogenic Protein (BMP)-signalling pathway inhibitor, suggesting that BMPs may be involved in Claudin-6 expression and epithelialization. These studies establish Claudin-6 as a very early marker of epithelialization and provide evidence that the BMP signalling pathway may be one of the ways that its expression is regulated. These studies also support the power of in vitro ES cell technology to identify and screen novel molecules involved in the early epithelialization of the mouse embryo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations133
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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