SINGAPORE ISOLATES OF THE DINOFLAGELLATE <i>GYMNODINIUM CATENATUM</i> (DINOPHYCEAE) PRODUCE A UNIQUE PROFILE OF PARALYTIC SHELLFISH POISONING TOXINS<sup>1</sup>
Notice bibliographique
Résumé
We investigated the cell morphology, toxicity and toxin composition, and rDNA sequences of clonal cultures of the chain‐forming dinoflagellate Gymnodinium catenatum H.W.Graham isolated from the port of Singapore. The cell morphology was consistent with most descriptions of this species except for sparsely distributed putative trichocyst pores visible on some cells under SEM. Nucleotide sequences (697 base pair) of the D1–D2 conserved regions and intervening variable domain of the large subunit rDNA were identical among isolates from Singapore and those of all other global populations examined so far (from Australia, China, Japan, Korea, New Zealand, Spain, and Uruguay), and this is consistent with the morphological conservatism of the species. Among isolates of G. catenatum that produce toxins associated with paralytic shellfish poisoning, the cellular toxicity of Singapore clones, as determined by intraperitoneal mouse bioassay (30–50 pg saxitoxin equivalents·cell−1) and immunoassay (24 ± 8 saxitoxin equivalents·cell−1) was relatively high. The mouse bioassay toxicity was comparable with that of Spanish and Philippine isolates that have undergone acid hydrolysis. However, analysis of toxin composition of Singapore clones by HPLC with fluorescence detection or HPLC‐mass spectrometry/mass spectrometry revealed a unique toxin profile that was dominated by the highly potent carbamate toxins, primarily gonyautoxin (GTX) 1 and 4 with lesser amounts of GTX2, GTX3, neosaxitoxin, and saxitoxin. No N ‐ sulfocarbamoyl, decarbamoyl, or deoxy‐decarbamoyl toxins were detected. In contrast, less potent N ‐ sulfocarbamoyl toxins dominate the toxin profiles of all other global populations examined to date (from Australia, China, Japan, New Zealand, the Philippines, Portugal, Spain, and Uruguay). The lack of genetic diversity found among broadly distributed populations of G. catenatum is consistent with the hypothesis of a relatively recent global spread of this species. Yet the unique toxin profile of Singapore strains indicates that it is unlikely that this strain has been recently translocated from any of the populations with characterized toxin profiles. In any case, the unique carbamate‐dominated toxin profile may be a useful signature to identify the potential spread of this strain from the port of Singapore, one of the world's busiest.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».