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Enregistrement W2036976345 · doi:10.1021/ci300514v

Identification of Novel Androgen Receptor Antagonists Using Structure- and Ligand-Based Methods

2013· article· en· W2036976345 sur OpenAlexafffund
Huifang Li, Xin Ren, Eric Leblanc, Kate Frewin, Paul S. Rennie, Artem Cherkasov

Notice bibliographique

RevueJournal of Chemical Information and Modeling · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBicalutamideAndrogen receptorAntiandrogensEnzalutamideProstate cancerVirtual screeningComputational biologyChemistryDrug discoveryPharmacologyCombinatorial chemistryBiologyCancerMedicineBiochemistryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Androgen receptor (AR) plays a critical role in the development and progression of prostate cancer (PCa). The AR hormone-binding site (HBS) is intensively studied and represents the target area for current antiandrogens including Bicalutamide and structurally related Enzalutamide. As resistance to antiandrogens invariably emerges in advanced prostate cancer, there exists a high medical need for the identification and development of novel AR antagonists of different chemotypes. Given the wealth of structural information on the AR in complex with a variety of ligands, we have applied an integrated structure- and ligand-based virtual screening methodology to identify novel AR antagonists. Virtual hits generated by a consensus voting approach were experimentally evaluated and resulted in the discovery of a number of structurally diverse submicromolar antagonists of the AR. In particular, one identified compound demonstrated anti-AR potency in vitro that is comparable to the clinically used Bicalutamide. These results set a ground for the development of novel classes of PCa drugs that are structurally different from current AR antagonists.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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