Structural Investigation of Protonated Azidothymidine and Protonated Dimer
Notice bibliographique
Résumé
Infrared multiple photon dissociation (IRMPD) spectroscopy experiments and quantum chemical calculations have been used to explore the possible structures of protonated azidothymidine and the corresponding protonated dimer. Many interesting differences between the protonated and neutral forms of azidothymidine were found, particularly associated with keto-enol tautomerization. Comparison of computational vibrational and the experimental IMRPD spectra show good agreement and give confidence that the dominant protonated species has been identified. The protonated dimer of azidothymidine exhibits three intramolecular hydrogen bonds. The IRMPD spectrum of the protonated dimer is consistent with the spectrum of the most stable computational structure. This work brings to light interesting keto-enol tautomerization and exocyclic hydrogen bonding involving azidothymidine and its protonated dimer. The fact that one dominant protonated species is observed in the gas phase, despite both the keto and enol structures being similar in energy, is proposed to be the direct result of the electrospray ionization process in which the dominant protonated dimer structure dissociates in the most energetically favorable way.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».