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Enregistrement W2037136453 · doi:10.1021/bi034257w

Analysis of Catalytic Carboxylate Mutants E552Q and E1197Q Suggests Asymmetric ATP Hydrolysis by the Two Nucleotide-Binding Domains of P-Glycoprotein

2003· article· en· W2037136453 sur OpenAlexaff
Isabelle Carrier, Julien Michel, Piet Gros

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleotideMutantChemistryEnzymeBiochemistryCyclic nucleotide-binding domainStereochemistryATP hydrolysisVanadateATPase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the nucleotide-binding domains (NBDs) of ABC transporters, such as mouse Mdr3 P-glycoprotein (P-gp), an invariant carboxylate residue (E552 in NBD1; E1197 in NBD2) immediately follows the Walker B motif (hyd(4)DE/D). Removal of the negative charge in mutants E552Q and E1197Q abolishes drug-stimulated ATPase activity measured by P(i) release. Surprisingly, drug-stimulated trapping of 8-azido-[alpha-(32)P]ATP is still observed in the mutants in both the presence and absence of the transition-state analogue vanadate (V(i)), and ADP can be recovered from the trapped enzymes. The E552Q and E1197Q mutants show characteristics similar to those of the wild-type (WT) enzyme with respect to 8-azido-[alpha-(32)P]ATP binding and 8-azido-[alpha-(32)P]nucleotide trapping, with the latter being both Mg(2+) and temperature dependent. Importantly, drug-stimulated nucleotide trapping in E552Q is stimulated by V(i) and resembles the WT enzyme, while it is almost completely V(i) insensitive in E1197Q. Similar nucleotide trapping properties are observed when aluminum fluoride or beryllium fluoride is used as an alternate transition-state analogue. Partial proteolytic cleavage of photolabeled enzymes indicates that, in the absence of V(i), nucleotide trapping occurs exclusively at the mutant NBD, whereas in the presence of V(i), nucleotide trapping occurs at both NBDs. Together, these results suggest that there is single-site turnover occurring in the E552Q and E1197Q mutants and that ADP release from the mutant site, or another catalytic step, is impaired in these mutants. Furthermore, our results support a model in which the two NBDs of P-gp are not functionally equivalent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,634

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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