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Enregistrement W2037146518 · doi:10.1094/pdis-08-10-0584

The Golden Potato Cyst Nematode <i>Globodera rostochiensis</i> Pathotype Ro1 in the Saint-Amable Regulated Area in Quebec, Canada

2010· article· en· W2037146518 sur OpenAlexaffabout
A. Mahran, Susan Turner, Trevor Martin, Qing Yu, Stephen E. Miller, F. Sun

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlobodera rostochiensisBiologySolanum tuberosumPotato cyst nematodeCultivarPEST analysisSolanumSolanaceaeGlobodera pallidaHorticultureAgronomyIndustrial cropNematodeBotanyEcologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The golden potato cyst nematode, Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923) Behren, is an economically important parasite of potato (Solanum tuberosum L. subsp. tuberosum) and is recognized as a quarantine pest internationally (2). This pest attacks potato plants and causes stunting of the haulm and the root system, leaf yellowing, and tuber yield losses (2). The pathotype scheme proposed by Kort et al. distinguishes five pathotypes (Ro1, Ro2, Ro3, Ro4, and Ro5) of G. rostochiensis using differential Solanum clones (1). Several resistance genes and quantitative trait loci (QTL) that have been identified in wild Solanum species confer resistance to different G. rostochiensis pathotypes and have been introgressed into commercial potato cultivars (2). Determining G. rostochiensis pathotype(s) is essential to implement efficient management strategies, which include using resistant potato varieties. G. rostochiensis was discovered in the municipality of Saint-Amable, Quebec (QC), Canada in 2006 (3) and was subsequently characterized (4). In this study, cysts were collected from 11 representative infested fields and confirmed to be G. rostochiensis (3). The pathotypes of these nematodes were assessed on seven differential clones (S. tuberosum subsp. tuberosum cv. Desiree, S. tuberosum × S. andigena cv. Maris Piper, S. kurtzianum hybrid 60.21.19, S. vernei hybrid 62.33.3, S. vernei hybrid 58.1642/4, S. vernei hybrid 65.346/19, and S. multidissectum hybrid P55/7) in 2007 and 2009. Briefly, in each 1-liter plastic pot containing 907 g (2 lbs) of soil (3:1 loam/grit v v-1), a single differential Solanum clone was planted and 15 cysts from 1 of 11 fields were inoculated. Five replicates were set up for each Solanum-nematode combination and the pots were arranged in a completely randomized design in a greenhouse at 22°C with a 16-h light period per day. Nine weeks after inoculation, cysts were extracted from each pot and counted. Reproduction factor (Rf) for each replicate was calculated (Rf = Pf/Pi; Pf is the final cyst number and Pi is the initial cyst number added to each pot). Rf values were used to categorize the differential clones into two groups, "susceptible" leading to increase in nematode numbers (Rf > 1) and "resistant" resulting in decrease in nematode numbers (Rf ≤ 1) (1). Our results in 2007 and 2009 were consistent and the pathotype of the nematodes collected from all the fields were identified as Ro1. To our knowledge, this is the first time that the pathotype of G. rostochiensis in the Saint-Amable regulated area was identified. Accordingly, potato cultivars carrying genes or QTL resistant to G. rostochiensis pathotype Ro1 can be used to reduce the nematode numbers in infested fields in the Saint-Amable area, QC. References: (1) J. Kort et al. Nematologica 23:333, 1977. (2) R. J. Marks and B. B. Brodie. Potato Cyst Nematodes: Biology, Distribution, and Control. 1st ed. CAB International, Wallingford, 1998. (3) F. Sun et al. Plant Dis. 91:908, 2007. (4) Q. Yu et al. Can. J. Plant Pathol. 32:264, 2010.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,699
Score d'incertitude au seuil0,395

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,167
Écart entre enseignants0,161 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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