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Enregistrement W2037347794 · doi:10.1002/arch.20028

Mutational analysis of the n-terminus inSchistocerca gregaria ion-transport peptide expressed inDrosophila Kc1 cells

2004· article· en· W2037347794 sur OpenAlexaff
Yunpo Zhao, J. Meredith, Hugh W. Brock, J. E. Phillips

Notice bibliographique

RevueArchives of Insect Biochemistry and Physiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAmino acidLocustBiochemistryAlaninePeptideSchistocercaPeptide sequenceMutantConserved sequenceMigratory locustGeneBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The functions of the 6-7 amino acid N-terminal domain conserved in insect and crustacean members of the hyperglycemic hormone (CHH) family were assayed by site-directed mutagenesis of Schistocerca gregaria ion-transport peptide (SchgrITP). Mutant peptides were expressed in Drosophila Kc1 cells and tested in a biological assay measuring stimulation of active Cl(-) transport across the locust ileum. We exchanged the N-terminal domain of SchgrITP with that of the shrimp Penaeus japonicus hyperglycemic hormone leaving the remainder of SchgrITP intact. The chimeric peptide was completely inactive in the ileal bioassay, showing that the N-terminus of SchgrITP is essential and that the 2 amino acids (phenylalanine-3 and aspartate-4) conserved in the shrimp and locust peptides are not sufficient for function. We made all possible alanine substitutions in the SchgrITP N-terminal domain. Only phenylalanines 2 and 3 were essential for function in the locust ileal bioassay. All N-terminal mutations were cleaved correctly from the prepropeptide, and expressed in similar concentrations as wild-type ITP suggesting the specific amino acids are not essential for these functions. Post-translational modification may explain a minor ITP isomorph observed in Drosophila Kc1 cell expression. Alanine substitution at position 2 produced a weak ITP antagonist. These structure-function studies, the first for any member of the CHH family, show that both conserved and unconserved amino acids contribute to SchgrITP ion-transport function and that the conserved aspartate in position 4 is required for a yet uncharacterized function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,112
Score d'incertitude au seuil0,842

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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