Molecular divergence between<i>Gryllus rubens</i>and<i>Gryllus texensis</i>, sister species of field crickets (Orthoptera: Gryllidae)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract We assess the degree of sequence divergence in the maternally inherited mitochondrial cytochromecoxidase I (COI) and cytochromeb(CytB) genes between two sister species of field crickets,Gryllus rubensScudder, 1902 andGryllus texensisCade and Otte, 2000. We analyzed 1460 base pairs from 10 individuals of each species; individuals were sampled from areas of both allopatry and sympatry. Overall average pairwise mitochondrial sequence divergence between species was 1.4% ± 0.1% (mean ± SD); however, there was almost an order of magnitude more divergence in COI (2.59% ± 2.25%) than in CytB (0.35% ± 0.24%).Gryllus texensisappears to harbor a much greater level of genetic variation than doesG. rubens. Phylogenetic trees constructed from these sequences show reasonable separation of species; however, sequences are not reciprocally monophyletic. Gene tree polyphyly may reflect recent species-level divergence and (or) interspecific gene flow. The pattern of sequence divergence and genetic variation in these taxa is consistent with allopatric or peripatric speciation in Pleistocene glacial refugia in the southeastern (G. rubensancestral lineage) and southcentral United States (G. texensisancestral lineage).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».