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Enregistrement W2037522102 · doi:10.1139/x08-097

Geographic variation in chloroplast haplotypes in the California red fir-noble fir species complex and the status of Shasta red fir

2008· article· en· W2037522102 sur OpenAlexvenueno aff
David K. Oline

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Forest Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest ecology and management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyIntrogressionRange (aeronautics)BotanyChloroplast DNAHaplotypePhylogeneticsGenotypeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

I present the results of a molecular investigation into taxonomically unresolved issues of the California red fir – noble fir species complex. Samples were collected throughout the range of California red fir ( Abies magnifica A. Murray), from the southern Sierra Nevada to the region in northern California and southern Oregon where morphological variation has suggested it hybridizes with noble fir ( Abies procera Rehder). Two rbcL sequences were found within A. magnifica and showed perfect linkage with variation at the chloroplast trnD locus. Only populations in the region of hypothesized hybridization were polymorphic for rbcL. One haplotype is unique to A. magnifica in the southern part of its range, and the other is identical to that found in A. procera to the north, supporting a broad zone of hybridization. There was no evidence for a cryptic geographic barrier between the two species. A single A. procera tree from southwestern Washington also had the A. magnifica haplotype, suggesting that introgression from A. magnifica may be widespread. The type locality of Abies magnifica var. shastensis Lemmon was polymorphic, whereas the disjuct southern A. magnifica var. shastensis was monomorphic for rbcL. I also present corrections, based on replication, to two rbcL sequences for A. magnifica previously deposited in GenBank.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,054

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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