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Enregistrement W2037588985 · doi:10.1194/jlr.m200374-jlr200

The amino acid sequences of the carboxyl termini of human and mouse hepatic lipase influence cell surface association

2003· article· en· W2037588985 sur OpenAlexaff
Robert Brown, Joshua R. Schultz, Kerry W.S. Ko, John S. Hill, Tanya A. Ramsamy, Ann L. White, Daniel L. Sparks, Zemin Yao

Notice bibliographique

RevueJournal of Lipid Research · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaThrombosis and Atherosclerosis Research InstituteUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExtracellularBiochemistryChemistryTributyrinCellAmino acidLipasePeptide sequenceMolecular biologyEnzymeBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human hepatic lipase (hHL) mainly exists cell surface bound, whereas mouse HL (mHL) circulates in the blood stream. Studies have suggested that the carboxyl terminus of HL mediates cell surface binding. We prepared recombinant hHL, mHL, and chimeric proteins (hHLmt and mHLht) in which the carboxyl terminal 70 amino acids of hHL were exchanged with the corresponding sequence from mHL. The hHL, mHL, and hHLmt proteins were catalytically active using triolein and tributyrin as substrates. In transfected cells, the majority of hHLs bound to the cell surface, with only 4% of total extracellular hHL released into heparin-free media, whereas under the same conditions, 61% of total extracellular mHLs were released. Like mHL, hHLmt showed decreased cell surface binding, with 68% of total extracellular hHLmt released. To determine the precise amino acid residues involved in cell surface binding, we prepared a truncated hHL mutant (hHL471) by deleting the carboxyl terminal five residues (KRKIR). The hHL471 also retained hydrolytic activity with triolein and tributyrin, and showed decreased cell surface binding, with 40% of total extracellular protein released into the heparin-free media. These data suggest that the determinants of cell surface binding exist within the carboxyl terminal 70 amino acids of hHL, of which the last five residues play an important role.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,226
Score d'incertitude au seuil0,425

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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