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Enregistrement W2037594336 · doi:10.1021/tx400232s

Identification of Danger Signals in Nevirapine-Induced Skin Rash

2013· article· en· W2037594336 sur OpenAlexafffund
Xiaochu Zhang, Amy Sharma, Jack Uetrecht

Notice bibliographique

RevueChemical Research in Toxicology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésInflammasomeChemistryRashReactive intermediateBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nevirapine (NVP) can cause serious skin rashes and hepatotoxicity. It also causes an immune-mediated skin rash in rats but not hepatotoxicity. This rash is caused by a metabolite of NVP; specifically, NVP is oxidized in the liver to a benzylic alcohol (12-OH-NVP), which travels to the skin where it forms a reactive benzylic sulfate. This could both act as a hapten and induce a danger signal. In contrast, most of the covalent binding in the liver involves oxidation of the methyl group leading to a reactive quinone methide. In this study, we examined the effects of NVP and 12-OH-NVP on gene expression in the liver and skin. Both NVP and 12-OH-NVP induced changes in the liver, but the list of genes was different, presumably reflecting different bioactivation pathways. In contrast, many more genes were up-regulated in the skin by 12-OH-NVP than by NVP, which is consistent with the fact that 12-OH-NVP is an obligate intermediate in the formation of the reactive sulfate in the skin. Genes up-regulated by 12-OH-NVP in the skin included TRIM63 (18-fold increase), S100a7a (7-fold increase), IL22-RA2 (4-fold increase), and DAPK1 (3-fold increase). TRIM63 acts as a ubiquitin ligase, which is consistent with protein damage leading to an increase in protein turnover. In addition, TRIM proteins are involved in inflammasome activation, and it appears that inflammasome activation is an essential step in the induction of NVP-induced skin rash. S100A7 is considered a danger signal, and its upregulation supports the danger hypothesis. Upregulation of the IL-22 RA2 gene marks an immune response. DAPK1 is involved with inflammasome assembly through binding directly to NLRP3, a NOD-like receptor expressed in keratinocytes. These results provide important clues to how NVP causes the induction of an immune response, in this case leading to skin rash.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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