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Enregistrement W2037654695 · doi:10.1139/g06-065

Novel events associated with phenotypic reversion of a <i>P</i> element mutant in <i>Drosophila melanogaster</i>

2006· article· en· W2037654695 sur OpenAlexafffundvenue
Kyle Anderson, Monica M. Davis, Ross B. Hodgetts

Notice bibliographique

RevueGenome · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésP elementTransposable elementBiologyReversionGeneticsMutantPhenotypeDrosophila melanogasterAlleleMutagenesisLocus (genetics)Transposon mutagenesisMolecular biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transposable P elements have been used extensively for Drosophila mutagenesis. While their mutagenic activity has long been recognized, the mechanisms by which P elements cause mutations are varied and not completely understood. We describe here an experiment to replace a P element at vestigial (vg) that caused a strong mutant phenotype (P[21-3]) with a P element (P[21]) known to produce a very weak phenotype when inserted at vg. In addition to testing the feasibility of P element replacements at vg, our investigation led to the production of 7 new vg alleles and 1 apparent second site suppressor. All the vg21-3 revertants that we recovered had a P element inserted into the first exon of vg at the same location and in the same orientation as the original element in vg21-3, providing a unique opportunity to study the mechanism of transposon mutagenesis. A majority of the revertants arose from a previously described event: internal deletion of P sequences, including the P promoter. In addition, 3 novel reversions of the vg21-3 wing phenotype were recovered. The wings of homozygous vg21r36 flies were normal. However, vg21r36 in combination with a deletion of the vg locus exhibited a strong mutant wing phenotype. This was surprising, because the P element insertion in vg21r36 was very similar to that found in the vg21 allele, which showed only slight nicking of the wings in combination with a deletion. In vg21r4, reversion was caused by a tandem insertion of P[21] and the original P[21-3] element present in vg21-3. Finally, the vg21r7 revertant had a P[21-3] insert at vg and 3 additional P elements elsewhere in the genome. We hypothesize that reversion in the 3 novel cases might be caused by P repressor produced by an element at vg or, in the case of vg21r7, elsewhere in the genome. This raises an interesting aspect of P element evolution. While P transposons produce mutations that might prove deleterious to their host, their success in invading the genome of D. melanogaster may be explained by their ability to silence those same mutations by a range of repressor-producing elements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2006
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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