The ZnuABC operon is important for <i>Yersinia ruckeri</i> infections of rainbow trout, <i>Oncorhynchus mykiss</i> (Walbaum)
Notice bibliographique
Résumé
Signature-tagged mutagenesis was used to identify genes essential for survival of Yersinia ruckeri in its natural host, rainbow trout, Oncorhynchus mykiss. A mini-Tn5-Km2 signature-tagged mutant, C6-1, was missing from rainbow trout kidney at 7 days after an immersion challenge. The transposon insertion in C6-1 was in a homologue of the znuA gene of Escherichia coli that encodes ZnuA, a zinc-binding periplasmic protein of the high-affinity zinc transporter ZnuABC. Further sequencing of the C6-1 locus in Y. ruckeri identified homologues of two other genes: znuB, encoding a putative inner membrane permease, and znuC, encoding a putative ATPase. When present on a low-copy plasmid, the znuABC locus of Y. ruckeri fully restored growth of a zinc transport-deficient DeltaznuABC mutant of E. coli. Unlike DeltaznuABC mutants of E. coli and Salmonella typhimurium, the DeltaznuABC mutant of Y. ruckeri did not demonstrate significantly slower growth in zinc-deficient M9 minimal medium or in Luria-Bertani (LB) medium supplemented with the metal chelators EDTA and tetrakis-(2-pyridylmethyl)-ethylenediamine (TPEN). In LB medium, the znuA::lacZ and znuCB::lacZ transcriptional fusions of Y. ruckeri were derepressed by addition of EDTA and TPEN and were repressed by addition of zinc and manganese. In a competitive challenge by immersion, the DeltaznuABC mutant was unable to compete with the parental strain and survived poorly in rainbow trout kidney, indicating that the ZnuABC transporter has a role in establishing and maintaining a rainbow trout infection by Y. ruckeri.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».