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Enregistrement W2037688286 · doi:10.1182/blood-2002-02-0568

The SCL complex regulates c-kit expression in hematopoietic cells through functional interaction with Sp1

2002· article· en· W2037688286 sur OpenAlexaff
Éric Lécuyer

Notice bibliographique

RevueBlood · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTranscription factorChromatin immunoprecipitationHaematopoiesisEctopic expressionChromatinCell biologyMolecular biologyZinc fingerTransfectionPromoterStem cellGeneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The combinatorial interaction among transcription factors is believed to determine hematopoietic cell fate. Stem cell leukemia (SCL, also known as TAL1 [T-cell acute lymphoblastic leukemia 1]) is a tissue-specific basic helix-loop-helix (bHLH) factor that plays a central function in hematopoietic development; however, its target genes and molecular mode of action remain to be elucidated. Here we show that SCL and the c-Kit receptor are coexpressed in hematopoietic progenitors at the single-cell level and that SCL induces c-kit in chromatin, as ectopic SCL expression in transgenic mice sustains c-kit transcription in developing B lymphocytes, in which both genes are normally down-regulated. Through transient transfection assays and coimmunoprecipitation of endogenous proteins, we define the role of SCL as a nucleation factor for a multifactorial complex (SCL complex) that specifically enhances c-kit promoter activity without affecting the activity of myelomonocytic promoters. This complex, containing hematopoietic-specific (SCL, Lim-only 2 (LMO2), GATA-1/GATA-2) and ubiquitous (E2A, LIM- domain binding protein 1 [Ldb-1]) factors, is tethered to DNA via a specificity protein 1 (Sp1) motif, through direct interactions between elements of the SCL complex and the Sp1 zinc finger protein. Furthermore, we demonstrate by chromatin immunoprecipitation that SCL, E2A, and Sp1 specifically co-occupy the c-kit promoter in vivo. We therefore conclude that c-kit is a direct target of the SCL complex. Proper activation of the c-kit promoter depends on the combinatorial interaction of all members of the complex. Since SCL is down-regulated in maturing cells while its partners remain expressed, our observations suggest that loss of SCL inactivates the SCL complex, which may be an important event in the differentiation of pluripotent hematopoietic cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations164
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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