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Enregistrement W2037757212 · doi:10.1080/09583150500532790

Preliminary phenotypic and molecular screening for potential bacterial biocontrol agents of<i>Leptosphaeria maculans,</i>the blackleg pathogen of canola

2006· article· en· W2037757212 sur OpenAlexaff
Rajesh Ramarathnam, W. G. Dilantha Fernando

Notice bibliographique

RevueBiocontrol Science and Technology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlacklegLeptosphaeria maculansBiologyCanolaPhyllospherePseudomonas chlororaphisRaphanusBrassicaMicrobiologyBacteriaBotanyPseudomonasGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Leptosphaeria maculans causes blackleg disease of canola (Brassica napus L.). Bacteria isolated from soil, canola stubble and plant parts were assayed for suppression of blackleg. In plate assays, the bacteria isolated from canola stubble had the highest agar-diffusible antifungal activity (75%), which was fungitoxic. In plant cotyledon assays, endophytes had the highest disease suppression. Bacteria with the highest disease suppression in cotyledon assays also had significant disease suppression at the three- to four-leaf stage. PCR screening for bacterial biosynthetic genes, commonly thought to be involved in plant disease suppression, revealed 22 bacteria to be positive for pyrrolnitrin. Pseudomonas chlororaphis and P. aurantiaca isolates contained the phenazine biosynthetic gene. Three Bacillus cereus isolates had the zmaR resistance gene. This study generated a novel set of primers specific to the zwittermicin A biosynthetic cluster. The PCR screening has confirmed the presence of genes encoding pyrrolnitrin (55%), phenazine (10%), zwittermicin A biosynthesis (7.5%) and zwittermicin A resistance (7.5%) from the canola phyllosphere and rhizosphere, which seems more widely distributed than genes for 2,4-diacetylphloroglucinol and pyoluteorin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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