Preliminary phenotypic and molecular screening for potential bacterial biocontrol agents of<i>Leptosphaeria maculans,</i>the blackleg pathogen of canola
Notice bibliographique
Résumé
Leptosphaeria maculans causes blackleg disease of canola (Brassica napus L.). Bacteria isolated from soil, canola stubble and plant parts were assayed for suppression of blackleg. In plate assays, the bacteria isolated from canola stubble had the highest agar-diffusible antifungal activity (75%), which was fungitoxic. In plant cotyledon assays, endophytes had the highest disease suppression. Bacteria with the highest disease suppression in cotyledon assays also had significant disease suppression at the three- to four-leaf stage. PCR screening for bacterial biosynthetic genes, commonly thought to be involved in plant disease suppression, revealed 22 bacteria to be positive for pyrrolnitrin. Pseudomonas chlororaphis and P. aurantiaca isolates contained the phenazine biosynthetic gene. Three Bacillus cereus isolates had the zmaR resistance gene. This study generated a novel set of primers specific to the zwittermicin A biosynthetic cluster. The PCR screening has confirmed the presence of genes encoding pyrrolnitrin (55%), phenazine (10%), zwittermicin A biosynthesis (7.5%) and zwittermicin A resistance (7.5%) from the canola phyllosphere and rhizosphere, which seems more widely distributed than genes for 2,4-diacetylphloroglucinol and pyoluteorin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».