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Enregistrement W2037902467 · doi:10.1016/j.ajpath.2013.03.021

Control of the Human Osteopontin Promoter by ERRα in Colorectal Cancer

2013· article· en· W2037902467 sur OpenAlexafffund
Salah Boudjadi, Gérald Bernatchez, Jean‐François Beaulieu, Julie Carrier

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal Of Pathology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Dental Protein Studies
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchAmerican Society for Investigative Pathology
Mots-clésOsteopontinCancer researchColorectal cancerCancerTumor progressionBiologyEstrogen-related receptor alphaTissue microarrayEstrogen receptorInternal medicineBreast cancerEndocrinologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Colorectal cancer is the second leading cause of death from cancer. Osteopontin (OPN) is a component of tumor extracellular matrix identified as a key marker of cancer progression. The estrogen-related receptor α (ERRα) has been implicated in endocrine-related cancer development and progression, possibly through modulation of cellular energy metabolism. Previous reports that ERRα regulates OPN expression in bone prompted us to investigate whether ERRα controls OPN expression in human colorectal cancer. Using a tissue microarray containing 83 tumor-normal tissue pairs of colorectal cancer samples, we found that tumor epithelial cells displayed higher staining for ERRα than normal mucosa, in correlation with elevated OPN expression. In addition, knocking down endogenous ERRα led to reduced OPN expression in HT29 colon cancer cells. Promoter analysis, inhibition of ERRα activity, and expression and mutation of potential ERRα response elements in the proximal promoter of human OPN showed that ERRα and its obligate co-activator, peroxisome proliferator-activated receptor γ co-activator-1 α, positively control human OPN promoter activity. Furthermore, chromatin immunoprecipitation experiments confirmed in vivo occupancy of the OPN promoter by ERRα in HT29 cells, suggesting that OPN is a direct target of ERRα in colorectal cancer. These findings suggest an additional mechanism by which ERRα participates in the development and progression of colorectal cancer, further supporting the relevance of targeting ERRα with antagonists as anticancer agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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