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Enregistrement W2037903127 · doi:10.1371/journal.pone.0019701

A Biophysical Model of Cell Adhesion Mediated by Immunoadhesin Drugs and Antibodies

2011· article· en· W2037903127 sur OpenAlexafffund
Ryan N. Gutenkunst, Daniel Coombs, Toby Starr, Michael L. Dustin, Byron Goldstein

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesU.S. Public Health ServiceMitacsU.S. Department of Energy
Mots-clésEpitopeJurkat cellsMonoclonal antibodyCell adhesionAdhesionCell biologyAntibodyCell adhesion moleculeCellBiologyChemistryT cellImmunologyBiochemistryImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A promising direction in drug development is to exploit the ability of natural killer cells to kill antibody-labeled target cells. Monoclonal antibodies and drugs designed to elicit this effect typically bind cell-surface epitopes that are overexpressed on target cells but also present on other cells. Thus it is important to understand adhesion of cells by antibodies and similar molecules. We present an equilibrium model of such adhesion, incorporating heterogeneity in target cell epitope density, nonspecific adhesion forces, and epitope immobility. We compare with experiments on the adhesion of Jurkat T cells to bilayers containing the relevant natural killer cell receptor, with adhesion mediated by the drug alefacept. We show that a model in which all target cell epitopes are mobile and available is inconsistent with the data, suggesting that more complex mechanisms are at work. We hypothesize that the immobile epitope fraction may change with cell adhesion, and we find that such a model is more consistent with the data, although discrepancies remain. We also quantitatively describe the parameter space in which binding occurs. Our model elaborates substantially on previous work, and our results offer guidance for the refinement of therapeutic immunoadhesins. Furthermore, our comparison with data from Jurkat T cells also points toward mechanisms relating epitope immobility to cell adhesion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,003
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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