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Enregistrement W2037968840 · doi:10.1210/endo.142.5.8170

Organization and Evolution of the Human Growth Hormone Receptor Gene 5′-Flanking Region*

2001· article· en· W2037968840 sur OpenAlexaff
Cynthia G. Goodyer, George Zogopoulos, Gary Schwartzbauer, Hong Zheng, Geoffrey N. Hendy, Ram K. Menon

Notice bibliographique

RevueEndocrinology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGrowth Hormone and Insulin-like Growth Factors
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clés5' flanking regionExonTATA boxBiologyGeneAlternative splicingMessenger RNAUntranslated regionMolecular biologyGeneticsRNA splicingStart codonPromoterGene expressionRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have identified eight variant human GH receptor (hGHR) messenger RNA (mRNAs; V1-V8), that differ in their 5'-untranslated regions (5'UTRs) but splice into the same site just upstream of the translation start site in exon 2; thus, they encode the same protein. Here we report a novel variant, V9, and describe the mapping of all nine 5'UTR sequences within 40 kb upstream of exon 2. A cluster of three sequences, V2-V9-V3 (termed module A), lies furthest 5', and approximately 16 kb downstream is a second cluster of four exons, V7-V1-V4-V8 (module B). V6 is midway between modules A and B. Module B is about 18 kb upstream of V5, which lies adjacent to exon 2. hGHR expression is under developmental- and tissue-specific regulation, and expression of the variant mRNAs is related to their position within the 5'-flanking region; whereas module A (V2,V9,V3) and V5 variants are widely expressed, module B (V7,V1,V4,V8) and V6 variant mRNAs are detectable only in postnatal liver. Transcriptional start sites for V1 and V9 (representing the two different modules) were identified, showing that postnatal liver-specific expression of V1 is driven from two TATA boxes, whereas the ubiquitous V9 transcript has a single start site and a TATA-less promoter. V9 promoter activity was shown by in vivo and in vitro transfection assays, and an NF-Y binding site was demonstrated by electromobility shift assay. Thus, the regulatory regions of the hGHR gene are complex, and the clustering of seven 5'UTR exons within two modules with distinctly different mRNA expression patterns is the most striking feature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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