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Enregistrement W2038031762 · doi:10.1139/w08-101

Biodiversity of <i>Trichoderma</i> strains in Tunisia

2009· article· en· W2038031762 sur OpenAlexvenueno aff
Najla Sadfi‐Zouaoui, Ibtissem Hannachi, Mustapha Rouaissi, Mohamed Rabeh Hajlaoui, M. Belén Rubio, Enrique Monte, Abdellatif Boudabous, Rosa Hermosa

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTrichodermaEdaphicBiologyCladeTrichoderma harzianumBiodiversityHypocreaBotanyInternal transcribed spacerEcologyPhylogeneticsSoil waterBiological pest controlRibosomal RNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Trichoderma strains were sampled in 4 different bioclimatic zones of Tunisia, a Mediterranean North African country with strong climatic and edaphic variability from north to south, to assess the genetic diversity of endemic species of Trichoderma and their relationship to the bioclimatic zones. In all, 53 strains were isolated and identified at the species level by analysis of their internal transcribed spacers regions 1 and 2 (ITS1 and ITS2) of the rDNA cluster and (or) a fragment of the translation elongation factor 1 (tef1) gene, using an online interactive key for species identification in Trichoderma and ex-type strains and taxonomically established isolates of Trichoderma as references. At least 2 different species were observed in each ecosystem. Trichoderma harzianum clade VI and Trichoderma longibrachiatum were present in forest soils in north Tunisia; Trichoderma atroviride and Trichoderma hamatum were found in cultivated fields in northeast Tunisia; T. harzianum clade VI, a Trichoderma sp. close to the T. harzianum complex, and Trichoderma saturnisporum were isolated from forest soils in central Tunisia; and T. harzianum clade II and T. hamatum were present in oasis soils in south Tunisia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,928
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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