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Enregistrement W2038109601 · doi:10.1074/jbc.275.14.10150

A Comparative Study of Calf Thymus DNA Binding to Cr(III) and Cr(VI) Ions

2000· article· en· W2038109601 sur OpenAlexaff
Hirohumi Arakawa, R. Ahmad, M. Naoui, Heidar‐Ali Tajmir‐Riahi

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-RivièresInnovation and Economic Development Trois Rivières
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryGuanineBinding constantDNAChromiumAqueous solutionChelationMolar concentrationFourier transform infrared spectroscopyBase (topology)Base pairNucleotideIonNuclear chemistryMetalMetal ions in aqueous solutionCrystallographyInorganic chemistryBinding sitePhysical chemistryOrganic chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chromium(VI) salts are well known to be mutagens and carcinogens and to easily cross the cell membranes. Because they are powerful oxidizing agents, Cr(VI) reacts with intracellular materials to reduce to trivalent form, which binds DNA. This study was designed to investigate the interaction of calf thymus DNA with Cr(VI) and Cr(III) in aqueous solution at pH 6.5-7.5, using Cr(VI)/DNA(P) molar ratios (r) of 1:20 to 2:1 and Cr(III)/DNA(P) molar ratios (r) of 1:80 to 1:2. UV-visible and Fourier transform infrared (FTIR) difference spectroscopic methods were used to determine the metal ion-binding sites, binding constants, and the effect of cation complexation on DNA secondary structure. Spectroscopic results showed no interaction of Cr(VI) with DNA at low anion concentrations (r = 1:20 to 1:1), whereas some perturbations of DNA bases and backbone phosphate were observed at very high Cr(VI) contents (r > 1) with overall binding constant of K = 508 M(-1). Cr(III) chelates DNA via guanine N-7 and the nearest PO(2) group with overall binding constant of K = 3.15 x 10(3) M(-1). Evidence for cation chelate formation comes from major shiftings and intensity variations of the guanine band at 1717 and the phosphate asymmetric stretching vibration at 1222 cm(-1). At low Cr(III) concentration (r = 1:40), the number of Cr(III) ions bound to DNA were 6-7 cations/500 base pairs, and this increased to 30-35 cations/500 base pairs at high metal ion content (r = 1:4). DNA condensation occurred at high cation concentration (r = 1:10). No major alteration of DNA conformation was observed, and the biopolymer remained in the B family structure upon chromium complexation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations268
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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