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Enregistrement W2038119277 · doi:10.1111/j.1537-2995.2011.03153.x

Interlaboratory assessment of a novel colony‐forming unit assay: a multicenter study by the cellular team of Biomedical Excellence for Safer Transfusion (BEST) collaborative

2011· article· en· W2038119277 sur OpenAlexaff
Maria Nawrot, David H. McKenna, Darin Sumstad, John D. McMannis, Zbigniew M. Szczepiorkowski, Helen Belfield, Elke Grassman, Toni Temples, Deanna Nielsen, Ning Yuan, Bert Wognum, Jo‐Anna Reems

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood transfusion and management
Établissements canadiensStemcell Technologies
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColony-forming unitCoefficient of variationInoculationProgenitor cellAndrologyBiologyMedicineAnimal scienceChemistryImmunologyChromatographyStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Interlaboratory scoring performances were determined using a traditional 14-day colony-forming unit (CFU) assay and a new 7-day CFU assay. STUDY DESIGN AND METHODS: Digital images of colonies were utilized to train personnel at each site. A central laboratory inoculated methylcellulose with progenitors and sent the samples by overnight courier to participating labs for plating. RESULTS: Colony counts from two digital images showed greater variability by novice counters (coefficients of variation [CV], 18.5 and 23.0%; n = 8) than for experienced staff (CV, 7.3 and 4.8%; n = 5). CFU assays plated immediately, 24 and 48 hours after methylcellulose inoculation displayed 39.5 CFU, 37.1 ± 10.6 (CV, 28%) and 34.8 ± 8.5 (CV, 24%) colonies for the 7-day assay and 39.5 CFU, 39.1 ± 9.9 (CV, 25%) and 37.1 ± 10.6 (CV, 28%) colonies for the 14-day assay, respectively. Overall, no significant differences in colony counts were noted between assays (p = 0.68). Also, no differences in CFU counts were seen when assays were set up immediately, 24 and 48 hours after methylcellulose inoculation (14-day p = 0.695; 7-day p = 0.632). CONCLUSION: Total CFUs obtained in 7- and 14-day CFU assays are comparable and show similar levels of interlaboratory variability. The major source of this variability is due to differences in how CFU plates are scored by individuals at different sites. UCB progenitor cells can be maintained in methylcellulose-based media at room temperature for up to 48 hours prior to transport without a significant loss in CFUs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,316
Score d'incertitude au seuil0,849

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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