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Enregistrement W2038136893 · doi:10.1086/523763

Coexistence of Panton‐Valentine Leukocidin–Positive and –Negative Community‐Associated Methicillin‐Resistant<i>Staphylococcus aureus</i>USA400 Sibling Strains in a Large Canadian Health‐Care Region

2008· article· en· W2038136893 sur OpenAlexaffabout
Kunyan Zhang, Jo‐Ann McClure, Sameer Elsayed, Jonathan C. Tan, John Conly

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPanton–Valentine leukocidinLeukocidinMicrobiologyStaphylococcus aureusMethicillin-resistant Staphylococcus aureusGenotypeBiologyStaphylococcal infectionsPopulationProphageSiblingSCCmecMedicineGeneGeneticsBacteriaEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) strains often carry the Panton-Valentine leukocidin (PVL) genes. However, the specific role that PVL plays in the epidemiological features and pathogenesis of CA-MRSA infections has remained undefined and controversial. Conducting a retrospective study on a natural population of MRSA clinical isolates recovered from community and hospital patients in a large Canadian health-care region during a 6-year period, we identified the coexistence of 2 USA400 (a major clonal group of CA-MRSA) sibling strains with and without PVL genes. Polymerase chain reaction and sequence analysis indicated that the PVL-carrying prophage phiSa2mw was present in PVL(+) but absent in PVL(-) USA400 isolates. These strains shared identical genotypic and phenotypic properties and similar clinical characteristics. This study provides direct evidence that PVL genes are not necessarily the key determinants associated with the increasing dissemination of CA-MRSA strains, suggesting that the genomic milieu may play a greater role in this regard.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,104
Score d'incertitude au seuil0,969

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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