Molecular markers for <i>Peristenus</i> spp. (Hymenoptera: Braconidae) parasitoids associated with <i>Lygus</i> spp. (Hemiptera: Miridae)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Molecular markers for identifying Peristenus spp. parasitoids to species level and preliminary molecular markers to distinguish two groups of Lygus spp. common to the Canadian prairies were developed. Peristenus species-specific polymerase chain reaction (PCR) primers were developed based on DNA sequence data from a 1600-bp region of the internal transcribed spacer region between the 5.8S and 18S nuclear rRNA genes (ITS2). These primers were able to distinguish Peristenus digoneutis Loan, Peristenus stygicus Loan, and Peristenus pallipes (Curtis). Their ability to identify to species-level parasites dissected from field-collected Lygus spp. nymphs was examined by analysis of DNA from 100 parasite samples. Of those samples showing positive PCR amplification with both control (ITS2) and species-specific primers, all were positive for P. pallipes; none of the samples amplified appropriately sized products with P. digoneutis specific or P. stygicus specific primers. These findings were validated using restriction enzyme digests of amplified regions of the Peristenus spp. cytochrome oxidase 1 gene. Both methods were consistent with earlier studies that showed P. pallipes to be the only species of the genus Peristenus to be associated with Lygus spp. on the Canadian prairies. PCR primers based on DNA sequence data from a 550-bp region of the mitochondrial 16S rRNA gene were designed to discriminate Lyguslineolaris (Palisot de Beauvois) from Lygus borealis (Kelton), and Lygus elisus (Van Duzee). These PCR primers were used to identify field-collected nymphs, with most being identified as either L. borealis/L. elisus (72–82%) orL. lineolaris (14–18%). These estimates of species composition closely reflected those of subsequent adult population surveys from the same fields.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».