The replicative activity of human endogenous retrovirus K102 (HERV-K102) with HIV viremia
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To address the activation and replicative activity of HERV-K102 in vivo associated with HIV viremia. DESIGN AND METHODS: Initially serology was performed on HERV-K102 specific envelope peptides to determine if HERV-K102 may become activated with HIV viremia. Before developing a quantitative PCR (qPCR) assay, we first determined whether plasma associated particles contained DNA or RNA genomes in a pilot study which surprisingly revealed predominantly DNA genomes. A relative, ddCt qPCR ratio method was then devised to detect excess levels of HERV-K102 pol DNA templates over genomic levels which served as a surrogate marker to reliably index the level of particles found in plasma. RESULTS: Both the peptide serology and ddCt qPCR excess ratio methods suggested the activation of HERV-K102 in about 70-80% of HIV viremic cases whereas only 2-3% of normal healthy adults had marginally activated HERV-K102 (P < 0.0001). Moreover, by digestion with dUTPase we were able to confirm that the vast majority of excess DNA template in plasma related to cDNA production rather than representing genomic copies. CONCLUSIONS: Our work uniquely suggests the common activation of HERV-K102 with HIV viremia and may be first to directly demonstrate HERV-K102 cDNA production in vivo. The potential implications of the induction of HERV-K102 activation and replication for the prevention and control of HIV are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».