Oligosaccharide recognition by antibodies: Synthesis and evaluation of talose oligosaccharide analogues
Notice bibliographique
Résumé
A series of monosaccharide (46), disaccharide (3,712), and trisaccharide (1315) analogs of the native ligand 2, which fills the binding site of monoclonal antibody Se 155.4, have been synthesized and their bioactivity measured by solid- and solution-phase assays. The syntheses of disaccharide analogs sought to replace galactose by various alkyl groups at the O-2 position of mannose. The activity of one of these O-2 alkyl analogs was 75% of that observed for the trisaccharide and points to only weak net bonding between the solvent exposed galactose residue and the antibody binding site. The synthesis of talose analogs 13 and 14, where the mannose or galactose residues of 2 were replaced by talose produced ligands with activities from one-third to one-half of that seen for the native ligand 2. These activity changes did not exhibit discernable correlations with the ability of talose to disrupt water of solvation.Key words: abequose, 3,6-dideoxy-D-xylo-hexose, talose disaccharide and trisaccharide, antibody oligosaccharide interactions, molecular recognition of carbohydrates, water in antibody complexes, Salmonella LPS, monoclonal antibody Se 155.4, bacterial O-antigen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».