Demonstration of the Iron-regulated Surface Determinant (Isd) Heme Transfer Pathway in Staphylococcus aureus
Notice bibliographique
Résumé
In this study, we report experimental results that provide the first complete challenge of a proposed model for heme acquisition by Staphylococcus aureus via the Isd pathway first put forth by Mazmanian, S. K., Skaar, E. P., Gaspar, A. H., Humayun, M., Gornicki, P., Jelenska, J., Joachmiak, A., Missiakas, D. M., and Schneewind, O. (2003) Science 299, 906-909. The heme-binding NEAT domains of Isd proteins IsdA, IsdB (domain 2), IsdC, and HarA/IsdH (domain 3), and the heme-binding IsdE protein, were overexpressed and purified in apo (heme-free) form. Absorption and magnetic circular dichroism spectral data, together with electrospray ionization mass spectrometry were used to unambiguously identify that heme transfers from NEAT-A through NEAT-C to IsdE. Heme transfer was demonstrated to occur in a unidirectional fashion in the sequence NEAT-B2 --> NEAT-A --> NEAT-C --> IsdE or, alternatively, initiating from NEAT-H3 instead of NEAT-B2: NEAT-H3 --> NEAT-A --> NEAT-C --> IsdE. Under the conditions of our experiments, only NEAT-H3 and NEAT-B2 could transfer bidirectionally, which is in the reverse direction as well, and only with each other. Whereas apo-IsdE readily accepted heme from holo-NEAT-C, it would not accept heme from holo-NEAT-A. Heme transfer to IsdE requires the presence of holo-NEAT-C, in agreement with the proposal that IsdC serves as the central conduit of the heme transfer pathway. These experimental findings corroborate the heme transfer model first proposed by the Schneewind group. Our data show that heme transport from the wall-anchored IsdH/IsdB proteins proceeds directly to IsdE at the membrane and, for this to occur, we propose that specific protein-protein interactions must take place.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».