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Enregistrement W2038440483 · doi:10.1139/z06-137

Mitochondrial DNA variation and matrilineal structure in blue sheep populations of Helan Mountain, China

2006· article· en· W2038440483 sur OpenAlexvenueno aff
Xiaoming Wang, Lirong Cao, Zhensheng Liu, Sheng‐Guo Fang

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Zoology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEast China Normal UniversityFok Ying Tong Education FoundationNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyMitochondrial DNAmtDNA control regionHypervariable regionHaplotypeMantel testGenetic diversityGenetic variationPopulationNucleotide diversityGenetic structureIsolation by distanceEvolutionary biologyZoologyGeneticsGenotypeDemographyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondrial DNA (mtDNA) control region (5′ hypervariable region, 554 bp) sequences from 71 samples of blue sheep ( Pseudois nayaur Hodgson, 1833) collected from six study localities throughout Helan Mountain Nature Reserve in Ningxia province of China were investigated to analyse distribution patterns of genetic variability, elucidate matrilineal structure, and investigate population history. Haplotype diversity (h) among the 71 samples was estimated to be 0.792 ± 0.037, and nucleotide diversity (Π) was relatively low (0.00392 ± 0.00046). A χ2contingency analysis of all mtDNA haplotype frequencies revealed that these haplotypes were distributed in a nonrandom fashion among study localities (χ2= 86.205, P = 0.092). Additional evidence of matrilineal structure was provided by the finding that a significant amount (9.02%; P < 0.01) of mtDNA variation was partitioned among different localities in the study area. We conclude that blue sheep of Helan Mountain Nature Reserve are structured spatially along matrilines. Pairwise computations of Φstand an AMOVA indicated that some sampling localities are differentiated relative to a random collection of genotypes and reflected differences in the spatial distribution of genetic variation. Isolation-by-distance (IBD) models (Mantel tests) revealed no obvious association between genetic differentiation and geographical distance. These results could be a basis for the development of suitable management strategies for conservation purposes. This work represents the first analysis of blue sheep mitochondrial control region DNA to be performed from a population genetics perspective.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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