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Enregistrement W2038454674 · doi:10.1111/j.1365-2893.2009.01111.x

Mutational analysis of the hepatitis C virus E1 glycoprotein in retroviral pseudoparticles and cell‐culture‐derived H77/JFH1 chimeric infectious virus particles

2009· article· en· W2038454674 sur OpenAlexfundno aff
Rodney S. Russell, Kazunori Kawaguchi, Jean‐Christophe Meunier, Shingo Takikawa, Kristina Faulk, Jens Bukh, Robert H. Purcell, Suzanne U. Emerson

Notice bibliographique

RevueJournal of Viral Hepatitis · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésInfectivityVirologyBiologyViral entryCD81Lipid bilayer fusionMutantVirusRetrovirusPeptideGlycoproteinHepatitis C virusViral replicationMolecular biologyGeneGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell entry by enveloped viruses is mediated by viral glycoproteins, and generally involves a short hydrophobic peptide (fusion peptide) that inserts into the cellular membrane. An internal hydrophobic domain within E1 (aa262-290) of hepatitis C virus (HCV) may function as a fusion peptide. Retrovirus-based HCV-pseudotyped viruses (HCVpp; genotype 1a) containing Ala or Pro substitutions at conserved amino acid positions within this putative fusion peptide were generated. Mutation of conserved residues significantly reduced efficiency of HCVpp entry into Huh-7 cells. The majority of amino acid substitutions appeared to disrupt necessary interactions between E1 and E2. For some mutants, reductions in HCVpp-associated E1 were associated with the incorporation of a high molecular weight, hyperglycosylated E2 that displayed decreased CD81-binding. Other entry-deficient mutants displayed normal E1E2 incorporation into pseudoparticles and normal CD81-binding, and therefore might affect viral fusion. One mutant (S283P) consistently displayed two- to threefold higher infectivity than did wild-type. Three mutations that decreased HCVpp infectivity also reduced levels of HCVcc infectious virus production. However, the S283P mutation had a different effect in the two systems as it did not increase production of infectious HCVcc. This comprehensive mutational analysis of the putative HCV fusion peptide provides insight into the role of E1 in its interaction with E2 and in HCV entry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,164
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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