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Enregistrement W2038459332 · doi:10.1088/0031-9155/57/21/7015

<i>In vitro</i>molecular magnetic resonance imaging detection and measurement of apoptosis using superparamagnetic iron oxide + antibody as ligands for nucleosomes

2012· article· en· W2038459332 sur OpenAlexaff
P. Rapley, C Witiw, Keith M. Rich, Sarah Niccoli, Mary Lynn Tassotto, John P.H. Th'ng

Notice bibliographique

RevuePhysics in Medicine and Biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensNOSM UniversityThunder Bay Regional Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleosomeHistoneMagnetic resonance imagingIn vitroApoptosisAntibodyNuclear magnetic resonanceDNA fragmentationBiophysicsIron oxide nanoparticlesSuperparamagnetismChemistryMaterials scienceCancer researchProgrammed cell deathBiologyDNANanotechnologyMedicineNanoparticleImmunologyBiochemistryMagnetizationPhysicsRadiologyMagnetic field

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent research in cell biology as well as oncology research has focused on apoptosis or programmed cell death as a means of quantifying the induced effects of treatment. A hallmark of late-stage apoptosis is nuclear fragmentation in which DNA is degraded to release nucleosomes with their associated histones. In this work, a method was developed for detecting and measuring nucleosome concentration in vitro with magnetic resonance imaging (MRI). The indirect procedure used a commercially available secondary antibody-superparamagnetic iron oxide (SPIO) particle complex as a contrast agent that bound to primary antibodies against nucleosomal histones H4, H2A and H2B. Using a multiple-echo spin-echo sequence on a 1.5 T clinical MRI scanner, significant T₂ relaxation enhancement as a function of in vitro nucleosomal concentration was measured. In addition, clustering or aggregation of the contrast agent was demonstrated with its associated enhancement in T₂ effects. The T₂ clustering enhancement showed a complex dependence on relative concentrations of nucleosomes, primary antibody and secondary antibody + SPIO. The technique supports the feasibility of using MRI measurements of nucleosome concentration in blood as a diagnostic, prognostic and predictive tool in the management of cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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