Leucine-Responsive Regulatory Protein Lrp and PapI Homologues Influence Phase Variation of CS31A Fimbriae
Notice bibliographique
Résumé
CS31A, a K88-related surface antigen specified by the clp operon, is a member of the type P family of adhesive factors and plays a key role in the establishment of disease caused by septicemic and enterotoxigenic Escherichia coli strains. Its expression is under the control of methylation-dependent transcriptional regulation, for which the leucine-responsive regulatory protein (Lrp) is essential. CS31A is preferentially in the OFF state and exhibits distinct regulatory features compared to the regulation of other P family members. In the present study, surface plasmon resonance and DNase I protection assays showed that Lrp binds to the distal moiety of the clp regulatory region with low micromolar affinity compared to its binding to the proximal moiety, which exhibits stronger, nanomolar affinity. The complex formation was also influenced by the addition of PapI or FooI, which increased the affinity of Lrp for the clp distal and proximal regions and was required to induce phase variation. The influence of PapI or FooI, however, was predominantly associated with a more complete shutdown of clp expression, in contrast to what has previously been observed with AfaF (a PapI ortholog). Taken together, these results suggest that the preferential OFF state observed in CS31A cells is mainly due to the weak interaction of the leucine-responsive regulatory protein with the clp distal region and that the PapI homolog favors the OFF phase. Within the large repertoire of fimbrial variants in the P family, our study illustrates that having a fimbrial operon that lacks its own PapI ortholog allows it to be more flexibly regulated by other orthologs in the cell.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».