Positive Selection of Tyrosine Loss in Metazoan Evolution
Notice bibliographique
Résumé
Cataloging Kinase Targets Protein phosphorylation is a central mechanism in the control of many biological processes (see the Perspective by Collins ). It remains a challenge to determine the complete range of substrates and phosphorylation sites altered by a kinase like cyclin-dependent kinase 1 (Cdk1), which controls cell division in yeast. Holt et al. (p. 1682 ) engineered a strain of yeast to express a modified Cdk1 molecule that could be inhibited by a specific small-molecule inhibitor. The range of Cdk1-dependent phosphorylation was assessed by quantitative mass spectrometry, which revealed many previously uncharacterized substrates for Cdk1. In addition to phosphorylation on serine and threonine residues, which appears to be evolutionarily ancient, tyrosine phosphorylation occurs primarily in multicellular organisms. Tan et al. (p. 1686 , published online 9 July) compared the overall presence of tyrosine residues in human proteins (which are frequently phosphorylated) and in yeast proteins (which are not). Loss of tyrosine residues has occurred during evolution, presumably to reduce adventitious tyrosine phosphorylation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».