Nephrin expression and three‐dimensional morphogenesis of the <i>Xenopus</i> pronephric glomus
Notice bibliographique
Résumé
Nephrin (NHPS1) encodes a transmembrane protein of approximately 1,200 amino acids that plays a critical role in podocyte slit-diaphragm formation and the development of functional mammalian glomerular filtration barriers. In humans and mice with congenital defects in the nephrin gene, the glomerular filtration barrier is defective and protein leakage into the kidney filtrate causes a life-threatening proteinuria. This protein also plays an essential role in the formation of the stellate cells of the Drosophila Malpighian tubules. In this report, the sequence and expression of a Xenopus ortholog of nephrin is described using both conventional and novel three-dimensional (3D) visualization methodologies. Xenopus nephrin encodes a protein of 1,238 amino acids and is expressed at high levels in the forming pronephric kidney glomus, the equivalent of the mammalian glomerulus. Expression commences at stage 25 and is specific to the pronephric glomus up until at least tadpole feeding stages. Two-color fluorescent whole-mount in situ analysis of nephrin expression allowed the 3D shape of the glomus to be imaged and contrasted to the pronephric tubules throughout its morphogenesis. Confocal data processing pipelines were established to generate both volumetric and surface models of the developing pronephros, and a Web-based visualization system was used to generate dynamic and manipulable models of the forming nephric organs. This system allows simple on-line morphometric analysis of the developing pronephric components. As in fish embryos, the glomera first form laterally then migrate medially as the pronephros matures. Unlike in the zebrafish, in Xenopus, this migration stops short of complete fusion of the two glomera at the midline, but a nephrin-positive glomeral nexus does form anteriorly and links the two structures from stage 38 onward.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».