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Enregistrement W2038829654 · doi:10.2174/138161212803523635

The Canadian Biomarker Integration Network in Depression (CAN-BIND): Advances in Response Prediction

2012· article· en· W2038829654 sur OpenAlexaffabout
Sidney H. Kennedy, Jonathan Downar, Kenneth Evans, Harriet Feilotter, Raymond W. Lam, Glenda MacQueen, Roumen Milev, Sagar V. Parikh, Susan Rotzinger, Cláudio N. Soares

Notice bibliographique

RevueCurrent Pharmaceutical Design · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueTryptophan and brain disorders
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesH. Lundbeck A/SWellcome Trust
Mots-clésPersonalized medicineNeuroimagingBiomarkerPrecision medicineMajor depressive disorderDepression (economics)MedicineBiomarker discoveryInformaticsModalitiesBioinformaticsMoodProteomicsPsychiatryPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Identifying biological and clinical markers of treatment response in depression is an area of intense research that holds promise for increasing the efficiency and efficacy of resolving a major depressive episode and preventing future episodes. Collateral benefits include decreased healthcare costs and increased workplace productivity. Despite research advances in many areas, efforts to identify biomarkers have not revealed any consistently validated candidates. Studies of clinical characteristics, genetic, neuroimaging, and various biochemical markers have all shown promise in discrete studies, but these findings have not translated into a personalized medicine approach to treating individual patients in the clinic. We propose that an integrated study of a range of biomarker candidates from across different modalities is required. Furthermore, advanced mathematical modeling and pattern recognition methods are required to detect important biological signatures associated with treatment outcome. Through an informatics-based integration of the various clinical, molecular and imaging parameters that are known to be important in the pathophysiology of depression, it becomes possible to encompass the complexity of contributing factors and phenotypic presentations of depression, and identify the key signatures of treatment response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,027
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,423
Score d'incertitude au seuil0,840

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,027
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,007
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,116
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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