MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2038913723 · doi:10.1139/w08-143

Production and biochemical and molecular characterization of a keratinolytic serine protease from chicken feather-degrading<i>Bacillus licheniformis</i>RPk

2009· article· en· W2038913723 sur OpenAlexvenueno aff
Nahed Fakhfakh, Safia Kanoun, Laïla Manni, Monçef Nasri

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKeratinaseBacillus licheniformisCaseinYeast extractProteaseSerine proteaseMolecular massThermostabilityBiochemistryEnzymeBiologyPhenylmethylsulfonyl FluorideEnzyme assayBacteriaChemistryFermentationBacillus subtilis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A novel feather-degrading bacterium was isolated from a polluted river and identified as Bacillus licheniformis RPk. The isolate exhibited high proteinase production when grown in chicken-feather media. Complete feather degradation was achieved during cultivation. Maximum protease activity (4150 U/mL with casein as a substrate and 37.35 U/mL with keratin as a substrate) was obtained when the strain was grown in a medium containing 7.5 g/L chicken feathers, 2 g/L yeast extract, 0.5 g/L NaCl, 0.1 g/L MgSO4 x 7H2O, 0.7 g/L KH2PO4, and 1.4 g/L K2HPO4 for 48 h with agitation of 200 rev/min at 37 degrees C. The major protease produced by B. licheniformis RPk was purified to homogeneity by a 3-step procedure. The molecular mass of the purified enzyme was estimated to be 32 kDa by SDS-PAGE and gel filtration. The optimum pH and temperature for the caseinolytic activity were around 11.0 and 65 degrees C, respectively. The optimum pH and temperature for the keratinolytic activity were 9.0 and 60 degrees C, respectively. The activity of the enzyme was totally lost in the presence of phenylmethylsulfonyl fluoride, which suggests that the purified enzyme is a serine protease. The thermostability of the enzyme was considerably enhanced in the presence of Ca2+ at temperatures >50 degrees C. The kerRP gene, which encodes the keratinolytic protease, was isolated, and its DNA sequence was determined. The deduced amino acid sequence revealed that the keratinase KerRP differs from KerA of B. licheniformis PWD-1, subtilisin Carlsberg, and keratinase of B. licheniformis by 2, 4, and 62 amino acids, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of MicrobiologyMême sujetEnzyme Production and CharacterizationTravaux en français237 207