MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2038925831 · doi:10.1210/me.2007-0387

Expression of the Hepatic Specific V1 Messenger Ribonucleic Acid of the Human Growth Hormone Receptor Gene Is Regulated by Hepatic Nuclear Factor (HNF)-4α2 and HNF-4α8

2007· article· en· W2038925831 sur OpenAlexafffund
Cynthia Cynthia, Zakaria Rhani, Hong Zheng

Notice bibliographique

RevueMolecular Endocrinology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University Health CentreMcGill University
Mots-clésBiologyHepatocyte nuclear factor 4Messenger RNAGene expressionNuclear receptorGeneReceptorLiver receptor homolog-1Hepatocyte nuclear factorsRegulation of gene expressionMolecular biologyTranscription factorEndocrinologyCell biologyInternal medicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human (h) GH plays an essential role in growth and metabolism, and its effectiveness is modulated by the availability of its specific receptor [hGH receptor (hGHR)] on target cells. The hGHR gene has a complex 5'-regulatory region containing multiple first exons. Seven are clustered within two small regions: V2,V3,V9 (module A) and V1,V4,V7,V8 (module B). Module A-derived mRNAs are ubiquitously expressed whereas those from module B are only found in postnatal liver, suggesting developmental- and liver-specific regulation of module B hGHR gene expression. To characterize the elements regulating module B activity, we studied a 1.8-kb promoter of the highest expressing exon in liver, V1. This promoter was repressed in transfection assays; however, either 5'- or 3'-deletions relieved this, suggesting the presence of multiple negative regulatory elements. Six putative hepatic nuclear factor 4 (HNF-4) response elements were identified. We determined that HNF-4alpha is developmentally regulated in the human liver: HNF-4alpha2 and HNF-4alpha8 are expressed in fetal hepatocytes but only HNF-4alpha2 is expressed in postnatal liver. Transient transfection assays demonstrated that HNF-4alpha2 and HNF-4alpha8 have a similar dual effect on V1 transcription: activation via site 1 in the proximal promoter and repression through site 6, approximately 1.7 kb upstream. EMSA/electrophoretic mobility supershift assays and chromatin immunoprecipitation analyses confirmed these two sites are bound by HNF-4alpha. Based on these data, we speculate there are multiple regions working together to repress the expression of V1 hGHR transcripts in tissues other than the normal postnatal liver, and that HNF-4alpha is a good candidate for regulating V1 hGHR expression in the human hepatocyte.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,067
Score d'incertitude au seuil0,610

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular EndocrinologyMême sujetPancreatic function and diabetesTravaux en français237 207