The<i>Aeromonas hydrophila</i>LuxR homologue AhyR regulates the<i>N</i>-acyl homoserine lactone synthase, AhyI positively and negatively in a growth phase-dependent manner
Notice bibliographique
Résumé
Aeromonas hydrophila is a pathogen of fish, amphibians and humans which produces N-acylhomoserine lactone quorum sensing signal molecules and possesses homologues of the Vibrio fischeri luxI and luxR quorum sensing genes termed ahyI and ahyR, respectively. The ahyI and ahyR genes of A. hydrophila comprise a divergon with a 62 bp intergenic region and control biofilm maturation and extracellular protease production. Stationary phase culture supernatants from an ahyR but not an ahyI mutant contain N-butanoylhomoserine lactone (C4-HSL) which is shown to be required for maximal ahyI expression. To determine whether AhyR regulates ahyI, the expression of AhyI was followed throughout growth by Western blot analysis. This revealed that AhyI can be detected in the exponential phase but appears to be degraded in stationary phase in the parent A. hydrophila strain. In an ahyR mutant however, the AhyI protein is only produced in stationary phase but production is sustained suggesting that AhyR controls the timing of AhyI production and turnover. By using RT-PCR, we mapped the transcriptional start site of ahyI which revealed that the 12 bp symmetrical lux-box like sequence present in the 62 bp ahyRI intergenic region overlaps with the -10 region of the ahyI promoter. To determine whether AhyR could bind to the ahyRI intergenic region, the ahyR gene was expressed and purified as a maltose binding protein (MalE) fusion. Electrophoretic mobility shift assays demonstrated that MalE-AhyR specifically bound to this sequence in both the presence and absence of N-butanoylhomoserine lactone (C4-HSL). Taken together, these data suggest that AhyR acts as both a negative and a positive regulator of ahyI and hence C4-HSL production in a growth phase dependent manner.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».