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Enregistrement W2038955183 · doi:10.1016/j.femsle.2004.10.011

The<i>Aeromonas hydrophila</i>LuxR homologue AhyR regulates the<i>N</i>-acyl homoserine lactone synthase, AhyI positively and negatively in a growth phase-dependent manner

2004· article· en· W2038955183 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Letters · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research Council
Mots-clésQuorum sensingBiologyElectrophoretic mobility shift assayHomoserineOperonMutantGeneMolecular biologyGene expressionGeneticsMicrobiologyVirulence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aeromonas hydrophila is a pathogen of fish, amphibians and humans which produces N-acylhomoserine lactone quorum sensing signal molecules and possesses homologues of the Vibrio fischeri luxI and luxR quorum sensing genes termed ahyI and ahyR, respectively. The ahyI and ahyR genes of A. hydrophila comprise a divergon with a 62 bp intergenic region and control biofilm maturation and extracellular protease production. Stationary phase culture supernatants from an ahyR but not an ahyI mutant contain N-butanoylhomoserine lactone (C4-HSL) which is shown to be required for maximal ahyI expression. To determine whether AhyR regulates ahyI, the expression of AhyI was followed throughout growth by Western blot analysis. This revealed that AhyI can be detected in the exponential phase but appears to be degraded in stationary phase in the parent A. hydrophila strain. In an ahyR mutant however, the AhyI protein is only produced in stationary phase but production is sustained suggesting that AhyR controls the timing of AhyI production and turnover. By using RT-PCR, we mapped the transcriptional start site of ahyI which revealed that the 12 bp symmetrical lux-box like sequence present in the 62 bp ahyRI intergenic region overlaps with the -10 region of the ahyI promoter. To determine whether AhyR could bind to the ahyRI intergenic region, the ahyR gene was expressed and purified as a maltose binding protein (MalE) fusion. Electrophoretic mobility shift assays demonstrated that MalE-AhyR specifically bound to this sequence in both the presence and absence of N-butanoylhomoserine lactone (C4-HSL). Taken together, these data suggest that AhyR acts as both a negative and a positive regulator of ahyI and hence C4-HSL production in a growth phase dependent manner.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle