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Enregistrement W2039025450 · doi:10.1016/j.taap.2015.02.012

Sex-related differences in murine hepatic transcriptional and proteomic responses to TCDD

2015· article· en· W2039025450 sur OpenAlexafffund
Stephenie D. Prokopec, John D. Watson, Jamie Lee, Raimo Pohjanvirta, Paul C. Boutros

Notice bibliographique

RevueToxicology and Applied Pharmacology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics, phytochemicals, and oxidative stress
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox Research Institute
Mots-clésBiologyEndocrinologyInternal medicineToxicityGenePhenotypeCytochrome P450Constitutive androstane receptorApoptosisTranscription factorNuclear receptorMetabolismGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD) is an environmental contaminant that produces myriad toxicities in most mammals. In rodents alone, there is a huge divergence in the toxicological response across species, as well as among different strains within a species. But there are also significant differences between males and females animals of a single strain. These differences are inconsistent across model systems: the severity of toxicity is greater in female rats than males, while male mice and guinea pigs are more sensitive than females. Because the specific events that underlie this difference remain unclear, we characterized the hepatic transcriptional response of adult male and female C57BL/6 mice to 500μg/kg TCDD at multiple time-points. The transcriptional profile diverged significantly between the sexes. Female mice demonstrated a large number of altered transcripts as early as 6h following treatment, suggesting a large primary response. Conversely, male animals showed the greatest TCDD-mediated response 144h following exposure, potentially implicating significant secondary responses. Nr1i3 was statistically significantly induced at all time-points in the sensitive male animals. This mRNA encodes the constitutive androstane receptor (CAR), a transcription factor involved in the regulation of xenobiotic metabolism, lipid metabolism, cell cycle and apoptosis. Surprisingly though, changes at the protein level (aside from the positive control, CYP1A1) were modest, with only FMO3 showing clear induction, and no genes with sex-differences. Thus, while male and female mice show transcriptional differences in their response to TCDD, their association with TCDD-induced toxicities remains unclear.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,709

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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